Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms