Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmod4Q9JLH8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmod4Q9JLH8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmod4Q9JLH8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmod4Q9JLH8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmod4Q9JLH8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmod4Q9JLH8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmod4Q9JLH8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms