Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms