Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms