Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms