Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne8Q9DC53 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne8Q9DC53 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne8Q9DC53 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne8Q9DC53 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne8Q9DC53 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne8Q9DC53 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne8Q9DC53 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms