Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms