Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Snx5Q9D8U8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Snx5Q9D8U8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Snx5Q9D8U8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Snx5Q9D8U8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Snx5Q9D8U8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Snx5Q9D8U8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Snx5Q9D8U8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Snx5Q9D8U8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snx5Q9D8U8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snx5Q9D8U8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snx5Q9D8U8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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