Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms