Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Batf3Q9D275 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms