Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms