Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms