Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms