Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms