Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik1Q60934 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms