Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms