Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d4Q5RJF7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d4Q5RJF7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d4Q5RJF7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d4Q5RJF7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d4Q5RJF7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d4Q5RJF7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d4Q5RJF7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d4Q5RJF7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms