Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms