Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms