Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssbp4Q3U4B1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms