Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam172aQ3TNH5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam172aQ3TNH5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms