Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Treml4Q3LRV9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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