Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms