Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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