Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NrepQ07475 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms