Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms