Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GscQ02591 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms