Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms