Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Lmo4P61969 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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