Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms