Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp1P58466 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms