Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Aqp4P55088 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms