Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PtpreP49446 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PtpreP49446 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpreP49446 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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