Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms