Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde6aP27664 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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