Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf271P15620 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf271P15620 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf271P15620 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf271P15620 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf271P15620 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms