Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf1P15314 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms