Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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