Protein–RNA interactions for Protein: P02088

Hbb-b1, Hemoglobin subunit beta-1, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-b1P02088 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hbb-b1P02088 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hbb-b1P02088 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hbb-b1P02088 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hbb-b1P02088 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hbb-b1P02088 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hbb-b1P02088 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hbb-b1P02088 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hbb-b1P02088 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hbb-b1P02088 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hbb-b1P02088 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hbb-b1P02088 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-b1P02088 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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