Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms