Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf12O54907 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms