Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnd2O35927 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnd2O35927 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms