Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3336J3QMQ6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3336J3QMQ6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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