Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21411J3KMS0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21411J3KMS0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21411J3KMS0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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