Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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