Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nfs1Q9Z1J3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms