Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms