Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms