Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms