Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clic3Q9D7P7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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